После принятия миссии бот тратит довольно много времени на перекладывание груза в карго: с момента закрытия почты (через которую идет разговор с агентом) и до того как груз окажется в карго индуса проходит около 20 секунд.
Около 10 секунд бот ждет прежде чем переместить курсор и выделить груз на станции, и столько же ждет прежде чем переместить груз в карго корабля. По сути, это самый долгий процесс. Все остальные действия выполняются в 2-4 раза быстрее.
Можно как-то ускорить перекладывание?

Ускорить вероятно можно отказавшись от дополнительных проверок (на случайное изменение размера карго например). Сейчас бот использует стандартные методы перекладывания в которых важна не столько скорость работы, как стабильность.